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免疫熒光實驗是根據抗原抗體反應的原理，先將已知的抗原或抗體標記上熒光素制成熒光標記物，再用這種熒光抗體（或抗原）作為分子探針檢查細胞或組織內的相應抗原（或抗體）。在細胞或組織中形成的抗原抗體復合物上含有熒光素，利用熒光顯微鏡觀察標本，熒光素受激發光的照射而發出明亮的熒光（黃綠色或桔紅色），可以看見熒光所在的細胞或組織，從而確定抗原或抗體的性質、定位，以及利用定量技術測定含量。
Masson染色用于膠原纖維和肌纖維的染色及鑒定；染色結果：膠原纖維呈藍色、肌纖維呈紅色、細胞核呈藍黑色。
PAS染色又稱過碘酸雪夫染色，糖原染色；一般用來顯示糖原和其他多糖物質。隨著醫學實驗技術的發展，糖原染色應用的范圍越加廣泛。
油紅O為脂溶性染料，在脂肪內能高度溶解，可特異性的使組織內甘油三酯等中性脂肪著色，油紅O脂肪染色法指在日常病理診斷和科研工作中為了顯示組織內的脂肪常采用油紅O進行染色的方法。
番紅-固綠染色（軟骨）在涉及關節軟骨及軟骨下骨的形態學研究中，常需要聯合使用多種染料以顯示其組織學結構。其中，起源于上世紀60年代的番紅O-固綠染色因可以直觀反映關節軟骨、軟骨下骨和骨組織的結構而備受青睞。
甲苯胺藍染色，該染色能夠清楚地顯示軟骨形態潮線等結構，觀察軟骨組織是否有損傷，軟骨呈鮮艷的紫色 （紫紅色）， 其他為淺藍色。
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